Судя по описанию вопроса, речь идёт о работе печки, и значит кондиционер не должен участвовать в истории, тем более он предназначен не греть, а остужать воздух салона.
Отопитель салона и кондиционер — разные устройства автомобиля (вернее сказать, у них разные, совершенно противоположные функции).
Может вы всё это знаете, но написал на всякий случай, потому что иногда вопросы здесь задают новички, которые просят написать всё подробно, хотят во всём разобраться самостоятельно (особенно когда и нет поблизости автосервиса).
Теперь о печке, об указанной вами проблеме: в вашей системе охлаждения присутствует воздух или выхлопные газы двигателя (в случае пробоя прокладки ГБЦ ). То есть радиатор отопителя салона завоздушивается, потому и начинает дуть холодный воздух.
Проверьте для начала уровень антифриза. Если он понижен, прежде чем долить новую порцию, осмотрите двигатель — нет ли подтёков, особенно на стыках шлангов, патрубков, штуцеров, тройников, на радиаторах и не мокрый ли сам радиатор охлаждения, а так же нет ли сырости в салоне под радиатором отопителя.
При работающем моторе загляните в расширительный бачок — не бурлят ли там пузырьки с запахом выхлопных газов. Если обнаружите этот вариант, тогда придётся снимать головку блока цилиндров и менять прокладку, естественно перед этим проверив плоскость (не повело ли её).
Напишите что обнаружите. Потом дальнейшие инструкции (советы).